猫也容易受到严重的先天缺陷的影响，这些缺陷会在整个生命中影响猫的健康，且无法避免，甚至常常无法治愈。一个例子就是猫的小脑发育不全，这是一种神经系统障碍。这是一种先天性病症，猫自出生起就有这种状况。具体来说，在小脑发育不全的情况下，猫的大脑没有在子宫里正常发育。更确切地说，猫的小脑发育不全是指猫的小脑发育较弱，小脑位于大脑下方。小脑主要负责理解能力以及运动协调，包括空间意识——因此，发生小脑发育不全时，这些能力会受到影响。通常这并不是一种危及猫生命的疾病。然而，它肯定会影响到猫的日常生活。损伤小脑的程度也很重要，因为会出现较重和较轻的病例。
小脑发育不全发生在怀孕的母猫接触某些类型的病毒时，这些病毒会攻击胎儿。它也可能因外伤而发生。此外，这种病症有时是猫的DNA中记录的，并代代相传。如果确诊为遗传基础，建议立即对猫进行绝育。诊断这种疾病时，兽医很可能会要求进行一系列测试，以确定病因。
如上所述，小脑发育不全影响猫的运动协调，因此，这些猫在移动、行走和奔跑时会遇到问题。它们无法保持平衡，难以定位物体。它们在行走时有时会侧着移动头部。此外，它们会不受控制地摇晃。在更严重的情况下，甚至可能出现肢体撕裂的情况。
猫的小脑发育不全通常在小猫4到6周大时被发现。当它们开始行走时，疾病会立即显现。值得注意的是，这并不是一种疼痛性的疾病，猫不会感到持续的疼痛。这种病症只是一种永久性的，随时间推移，它的症状不会减轻，也不会恶化。这种病症的严重程度各不相同，从非常严重的病例（猫无法独立生存，需要帮助）到轻微病例。如果这样的小猫能找到好主人，它们的照顾者可以教它们如何改善生活。
值得记住的是，猫的小脑发育不全并不意味着立刻判决。猫可以与其共存，并相对正常地生活，前提是它们的主人能够提供支持与帮助。这个病症有时有非常轻微的表现。不幸的是，没有治愈这种病症的方法。在非常严重的情况下，通常需要进行安乐死，以减轻猫的痛苦。人们认为，患有小脑发育不全的猫不应该离开自己的居住地，以确保它们的安全。